Meistriliiga
FC Flora Tallinn
FC TVMK
FC Levadia Maardu
JK Narva Trans
JK Tulevik Viljandi
FC Levadia Tallinn
FC Lootus Kohtla-Järve
FC Pärnu Levadia

Esiliiga
FC Kuressaare
FC Valga
Maardu Jalgpalliklubi
JK Merkuur Tartu
FC Elva
JK Sillamäe Kalev
Tartu JK Tammeka
Tallinna Jalgpalliklubi

II liiga
Ida/Põhi
Kick Sai Narva
FS Junior
M.C. Tallinn
Dvigatel
Tartu Ülikool Fauna
F.C.A. Estel

Lääs/Lõuna
HÜJK Emmaste
JK Tervis Pärnu
Pärnu JK Vaprus
Sörve JK
FC Hiiu Kalur (Kotkas)
Kompanii Märjamaa

III liiga
Põhi
JK Dünamo
SK ESS
Fortuna Tallinn
Nõmme Kalju
Trummi SK
Saue JK
FC Concordia
S.C. Real
ETSK Haapsalu
F.C.A. Estel- 85

Lõuna
JK Karksi
Tarvastu JK
JK Võru
Võhma Linnameeskond
Koeru SK
SK Lemons
Põltsamaa JK Sport
Viljandi PT
FC Valga II
Pärnu Pataljoni JK

Ida
Tamme Auto
Paide JK
JK Alko
Kuusalu SK Rada
SK Tapa
FK Spartak
Kalev Junior Sillamäe
Jõhvi JK Orbiit
Loksa RSK
JK Voka

Lääs
FC Lelle
Keila JK Alibi
FC Kose
FC Mõigu- Rae
Turba NJK
FC Kernu Kadakas
FC Hansa United
Tabasalu Palliklubi
FC Klooga
Pakri SK

IV liiga
Põhi
Saku JK
SK Mercury
JK Piraaja
LiVal Sport
FC Olympic
JK Tondi
FC Mets&Puu
FC Kuristiku
Kristiine JK
FC Goll

Lõuna
FC Lootos
SK Kirm
Valga FC Warrior
Jõgeva SK Tähe
Roosna- Alliku SK
Räpina SK
SK Patarey
FC Elva II
FC Flora Järva-Jaani
Olümpia-2000

Ida
Flexa Aseri
Kehra Tempori
Dünamo Kopli
JK Kaitseliit/Kalev
FC Energia
FC Jyri
Tallinna JK II
FC Joker
F.C.A. Estel- 86
Turba NJK II

Lääs
Lelle SK
International
Emmaste JK
Keskerakonna Noortekogu
FC Toompea
Kehtna SK Kespo
KSK Kespo Kehtna
FC Spiritas
FC EBS Team
1188 Infoabi

V liiga
Ida/Põhi
FC Reaal
Rapla JK Atli
Euroniv FC
FC Soccernet
Tiigrid
Tallinna Prantsuse Lütseum
JK Minevik
Pelgulinna JK
FC Q United

Lääs/Lõuna
Muhumaa JK
JK Tajak
FC Comwell
T.F.T. Töfting
FC Haapsalu
Järvakandi JK Tribling
Pärnu JK
Kespo II
FC Haiba

Naised
TKSK Visa
F.C.A. Estel
Pärnu JK
Pärnu Bussipark
FC Flora Tallinn
JK Viljandi Tulevik
Kehtna EVL/OLEE

Nimemuudatused:
Sillamäe Kalev nüüd Alstom Kick Sai
Alstom Kick Sai nüüd Sillamäe Kalev
TJK-83 nüüd Tallinna JK
Muhumaa JK nüüd JK Sörve
Aseri SK nüüd Flexa Aseri
Maardu S.C. Real nüüd Maardu JK
Tallinna JK Puuma nüüd Fortuna Tallinn
SK Silja Sport Võru nüüd JK Võru
Eesti Näitused nüüd F.C.A. Estel
Eesti Telefoni SK nüüd Haapsalu ETSK
FC Ajax Lasnamäe nüüd F.C.A. Estel
FC Ajax Lasnamäe II nüüd F.C.A. Estel-85
FC Hiiu Kalur nüüd FC Hiiu Kalur Kotkas
I.F.K. nüüd JK Tondi