Nyonis loositi paaridesse ka 32 UEFA karikasarja parimat meeskonda. Levadia konkurentsist lülitanud Newcastle sai vastaseks Zulte Waregemi
Meeskonnad olid jaotatud nelja potti:
- grupivõitjad (1. pott)
- gruppides teiseks jäänud (2.pott)
- gruppide kolmandad (3. pott)
- Meistrite Liiga alagruppide kolmandad (4. pott)
1. poti meeskonnad loositi kokku 3. poti meeskondadega. Seega teisest potist leidsid vastased neljanda poti meeskonnad. Kodumängueelise said 1. ja 2. poti meeskonnad. Ühe riigi meeskonnad ei saa kokku sattuda ning ka samast alagrupist ei loosita meeskondi kokku.
Esmalt loositi välja üks meeskond kolmandast potist ning sellele loositi vastane esimesest potist. Seejärel käituti samamoodi neljanda ja teise potiga.
Esimesena märgitud meeskonnad mängivad esimese mängu kodus.
1. mäng Esimesena loositi välja
SV Zulte Waregem Belgiast, kellele saadi vastaseks Levadia konkurentsist lülitanud
Newcastle United.
2. mäng SC Braga Portugalist kohtub Itaalias kesiselt esineva
Parmaga.
3. mäng Lens mängib
Panathinaikosega.
4. mäng Leverkusen Bayer kohtub
Blackburn Roversiga.
5. mäng Hapoel Tel-Aviv võistleb
Rangers Glasgow'ga.
6. mäng Livorno mängib võimsalt esinenud
Espnayoliga.
7. mäng Feyenoord Rotterdam sai vastaseks täiseduga lõpetanud
Tottenham Hotspuri.
8. mäng Fenerbahce võtab vastu
AZ Alkmaari.
Seejärel vahetati potte ning loositi järgmised 8 paari.
9. mäng Werder Bremeni sai vastaseks
Ajax Amsterdami.
10. mäng Moskva Spartakile sõidab külla
Celta Vigo.
11. mäng CSKA Moskva võtab vastu
Maccabi Haifa.
12. mäng AEK Ateena'le loositi konkurendiks
Paris Saint-Germain.
13. mäng Benfica peab edasipääsu pärast võitlema
Dinamo Bukarestiga.
14. mäng Eelmise aasta poolfinalist
Steaua Bukarest sai endale vastaseks tiitlikaitsja
Sevilla.
15. mäng Donetski Šahtar kohtub
Nancy Lorraine'ga
16. mäng Bordeaux Girondins mängib
Osasunaga.
Seejärel loositi ka 1/8-finaalpaarid, kes on järgmised.
1. mängu võitja (Zulte Waregem - Newcastle)
vs 8. mängu võitja (Fenerbahce - AZ)
11. mängu võitja (CSKA Moskva - Haifa)
vs 6. kohtumise võitja (Livorno - Espanyol)
5. mängu võitja (Haifa - Rangers)
vs 16. mängu võitja (Bordeaux - Osasuna)
2. mängu võitja (Braga - Parma)
vs 7. mängu võitja (Feyenoord - Tottenham)
14. mängu võitja (Steaua - Sevilla)
vs 15. mängu võitja (Šahtar - Nancy)
3. mängu võitja (Lens - Panathinaikos)
vs 4. mängu võitja (Leverkusen - Blackburn)
12. mängu võitja (AEK - PSG)
vs 13. mängu võitja (Benfica - Dinamo Bukarest)
10. mängu võitja (Spartak Moskva - Celta Vigo)
vs 9. mängu võitja (Bremen - Ajax)